STAIN Watampone adalah salah satu perguruan tinggi negeri di kawasan timur Indonesia di bawah naungan Kementrian Agama
yang memiliki kewenangan menyelenggarakan pendidikan secara mandiri.

Sekalipun nama STAIN WATAMPONE masih baru, namun cikal bakal STAIN Watampone telah ada sejak 37 tahun lalu dengan
nama Universitas Islam Raya, kemudian meningkat menjadi Fakultas Syariah Cabang IAIN Alauddin Ujung Pandang (tahun
1966 – 1982). Selanjutnya sejak tahun 1982 sampai dengan 1987 menjadi fakultas Madya dengan nama Fakultas Syariah
Watampone.

Sejak berdiri pada tahun 1966 sampai dengan tahun 1997, perguruan tinggi ini telah mengalami kemajuan yang signifikan,
dengan didukung oleh tenaga pengajar profesional dan tenaga teknis yang terampil serta sarana dan prasarana yang terus
dikembangkan sehingga tidak kalah bersaing dengan perguruan tinggi lainnya dalam menghadapi tantangan dan persaingan
global.

Pada tanggal 21 Maret 1997 M, bertepatan dengan tanggal 12 Dzulqaidah 1417 H berdasarkan Keputusan Presiden RI Nomor
11 Tahun 1997, pemerintah menaikkan status Fakultas Syariah Watampone menjadi Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri
(STAIN) Watampone, dengan dua jurusan yaitu jurusan Syariah dan jurusan Tarbiyah. Saat ini, STAIN Watampone memiliki 81
dosen berkualifikasi S2 dan S3, sementara dosen yang masih berpendidikan S1 saat ini tenaga melanjutkan pendidikan pada
program Pascasarjana pada beberapa Universitas. Adapun staf administrasi terdiri dari 34 orang, yang terbagi ke dalam tiga
Subbag, yaitu : Subbag Umum, Subbag Kepegawaian dan Keuangan serta Subbag Akademik dan Kemahasiswaan.
Untuk menyesuaikan diri dengan perkembangan teknologi, utamanya teknologi informasi dan komunikasi, STAIN WATAMPONE
Watampone telah mengaplikasikan sistem pendidikan berbasis ICT. Demikian pula halnya dengan data-data pegawai secara
lengkap dapat diakses secara online melalui website SIMPEG Departemen Agama yang terus ter-update. Informasi
perkembangan kampus terkini bahkan dapat diakses secara real-time dan interaktif melalui www.stainwatampone.ac.id.